Если приезжать в страну без разрешений от отца и только с российскими документами, то: 1. можно ли тогда пройти в аэропорту через натив? 2. как можно будет легально оставаться в Израиле, пока сыну не исполнится 18 лет?

Никак. Мы приехали без папы, но у нас везде спрашивала его согласие. В МВД оригинал.

Через натив только с визами. А так они просто российские туристы приехавшие к своему родственнику первой линии. Продлевать в МВД визу, предоставляя вескую причину для этого.

Через Натив очень даже нужно, только с предоставлением еврейских документов, дающих право репатриации. Сыну очевидно продлевать турвизу на основании процесса смены статуса, иначе легально никак.

Хорошо бы сыну, которому сейчас 17 лет получить школьный аттестат с оценками, то есть закончить школу в РФ, а только потом лететь на пмж в Израиль.