Подскажите осталось ли правило что нужно по прилету в Португалию заселиться в отель хотя бы на ночь чтобы потом этот документ при подаче в SEF использовать? Приезжает жена, в ЕС сразу в Португалию летит.

Тут все может меняться, тем более, что сейчас идет активная реструктуризация SEF. По этому, зная выкрутасы местных чиновников, я бы в любом случае это делал (и сделал). Мое субьективное...

В ЕС сразу в Португалию летит - зачем тогда в отель? Если влет непосредственно в Португалию, то будет штамп в паспорте. Отель нужен, если въезд в ПТ из другой страны Шенгена.

Если печать португальская будет в паспорте с датой пересечения границы, то можно не селиться в отель.