В марте получила Даркон. Собираюсь в Россию. Хочу подать уведомление о втором гражданстве.. Вопрос . На какие паспорта покупать билеты? Границу переходить в Израиле по Израильскому, а в России - по Российскому?

Билеты всё равно по какому покупать, главное, чтоб имя в билете совпадало с тем, что в паспорте. Ну, на всякий случай, лучше по даркону. Насчет границы всё верно: здесь выезжаете по даркону, в Россию въезжаете по российскому.

Да, и подавать либо МВД по прописке , либо через почту , через почту проще.