А при подаче на постоянное ВНЖ пошлину оплачивать по прибытию в консульство?

Да.

@Kirill: Граждане РФ временно не могут подаваться в посольстве, только в Литве.

@Соня: Казахстан, США, Грузия и Турция тоже не подойдут, только Литва.

@Соня: Секунду я что то щас думаю, получается если я заявление подам на мигрис, то оригиналы , мне в консульство нельзя привезти, только в Литву ?

@Kirill: Всё верно.

@Соня: А как мне попасть в Литву тогда , у меня есть право на востановление гражданства, ну бумаги об этом нету, просто я под программу подхожу и что делать?

@Kirill: Ллп, потом визу, потом внж/пмж.