Нахожусь в КЗ, с собой есть загранник но без штампа о выезде из РФ, заходил по внутреннему паспорту РФ.

Насколько мне известно, это не проблема. Главное - загран с собой. Даже если не дадут выехать в другую страну, Вы можете поехать в Кыргызстан через сухопутную границу - выехать из Казахстана по внутреннему паспорту, заехать в Кыргызстан по заграну. Либо же можете сделать то же самое туда-обратно. Съездить в Бишкек, вернуться в Казахстан, но уже по заграну.