Жена не еврейка родилась в Узбекистане у нее на руках повторное свидетельство о рождении, правильно я понимаю, что нужно делать на него апостиль Узбекистана и есть ли там расширенные справки как в России? она гражданка РФ.

Про справки не знаю, но апостиль нужен. Еще узнайте о справке в Узбекистане что она не была в иных браках до вас. И в рф тоже такую справку скорее всего надо если она стала гражданкй рф до брака с вами в узбекистане.

Свидетельство о рождении повторное где выдано? В России? Можно ли ли получить ей повторку СОБ российского образца? Если да, то делаете и на неё можно поставить апостиль в регионе выдачи.