Подскажите, через какую границу лучше ехать из Польши в РФ с визой Д?

Нарва или Гжехотки. Я постоянно мониторю ситуацию, и еще ни разу ни у кого каких-то нестандартных ситуаций среди моих знакомых и знакомых знакомых не было. Гжехотки в плане логистики хороши. Доехали до Калининграда и полетели куда надо. Нарва хороша, если в Питер быстро попасть надо. Можно и через Брест, но там, бывает, стоят на легковых по 16 часов, поэтому я туда лет 10 не ездил.

Самый лучший для Вас способ - это сесть на Калининградский поезд в Литве (Кяна) и доехать туда, куда надо (также если совсем переживаете, можете на этом поезде выйти в Беларуси там сесть на поезд типа ласточка между Бел и РФ и вообще будет идеально) + какой-никакой минимальный комфорт. Буквально на днях ездил таким способом знакомый.