У меня закончился загран паспорт РФ . Могу ли я полететь в Россию и вылететь с неё с загран паспортом Израиля ( дарконом)?

Официально, нет, не можете. Согласно законодательству РФ, въезд и выезд граждан РФ только по российским документам. Другой вопрос, смогут ли Вас опознать как гражданина РФ на погранконтроле. Несколько лет тому назад, как известно, такой вариант проходил. В последнее время достоверной инфы нет.

Не совсем так. На прилёте в РФ предъявите свой закончившийся загранпаспорт РФ. Здесь закажите новый загран. По нему уже будете вылетать обратно в IL. Въезжать в РФ/выезжать из РФ по даркону при наличии гражданства РФ вы не имеете права.