Есть родственник - гражданин ЕС, а точнее Литвы Она не живёт в Литве, но гражданкой является Имеет ли смысл вносить ее в анкету на испанскую визу под пунктом наличия родственников в ЕС?

Насколько близкий родственник? У меня куча родственников в ЕС, никого не указывал никогда. Думаю что стоит указывать только ближайших - родители, братья или сестры, дети.

Не стоит.

Это ничего вам не даст. Возможно этот пункт предусмотрен для тех кто по гостевой приглашению планирует поездку.