Подскажите , куда уходят пенсионные взносы(налог), вычитаемые из зарплаты? По факту я не гражданин Казахстана, и пенсию здесь получать не буду .

На вас должны были счёт открыть в ЕНПФ.

По пенсионному соглашению ЕАЭС при выходе на пенсию вы будете получать деньги от всех стран входящих в него , независимо от того где вы выйдете на пенсию. Раньше отчисления с нерезов не брали.