Подскажите если собственник живёт в другом городе, а квартиру сдаёт риэлтор, то временную регистрацию не сделать? Надо ли вместе в ЦОН идти?

Если у риэлтора есть доверенность на такие дела, то можно. Если нет, то нотариальное согласие и доверенность на иное лицо собственник может выписать в другом городе и либо прислать, либо в вашем городе другой нотариус может распечатать и заверить. У нотариусов единая система.