Подскажите. У дочери два паспорта Российский и Израильский. Есть необходимость приехать в Россию.

Дочь вышла замуж в Израиле?

Скорее всего нет, билеты лучше на росс паспорт, в России показать загран и готовиться к довольно долгой бюрократии - легализовывать брак в рф, менять внутренний паспорт, потом росс загран.

Проблемы на таможне могут быть, если везёте наличные больше разрешённого лимита или другие ценности не подлежащие вывозу. Фамилии в паспортах их не интересуют. Паспорта интересуют пограничников. В каждой стране гражданином которой являешься на границе нужно показывать действующий паспорт данной страны. Билет можно брать на любую фамилию из паспортов. Прямой связи с переходом границы тут нет.