Подскажите пожалуйста, возможно ли оплатить дополнительный багаж в компании pegasus из РФ с банковской карты?

Нет..картами РФ нельзя..делайте иностранные карты... есть сейчас и онлайн возможность удаленно их делать..

Попробуйте им написать, чтобы прислали счёт, который можно оплатить в российском банке.