Что писать в графе Planned duration of stay in number of days, если надеешься на получение мультивизы: кол-во дней первой поездки или писать прямо так сразу 90?)

То, что вы напишете, никак не влияет на результат, увы. Пишите количество планируемых дней первой поездки. В анкете есть еще вопрос о количестве планируемых выездов, по-моему, в ближайший год, можете написать несколько (в разумных пределах). А дадут так, как консул сочтет нужным. Мне, например, дали на 3 года, хоть я и писала про поездку на 2 недели. Кому-то при равных условиях дали на полгода.

Первую поездку , под которую показываете маршрут.

Я указывала количество дней первой поездки.