Подскажите, пожалуйста, а нострификация документа об образовании необходима на этапе регистрации компании и когда ты там устраиваешься генеральным директором или когда уже подаёшь документы на ВНЖ?

Когда подаешь документы на боравок (ВНЖ)

Однозначно на этапе открытия фирмы, ещё до подачи на ВНЖ.

Для открытия doo диплом не нужен, директором в свою фирму по сути вы устраиваетесь уже после получения внж, до этого только в уставной документации указываете, что потом вы будете директором. Но лучше подать на нострификацию заранее, если спешите. Можно параллельно ждать подтврды о нострификации из министерства и решения об открытии фирмы из регистра)