Подскажите, пожалуйста, если я получаю приглашение от эстонского работодателя, могут ли со мной муж и дочь переехать.

Приглашения от работодателя мало, нужно на основании этого приглашения получить визу Д, после этого вы переезжаете и подаются документы на мужа и дочь, воссоединение с семьей. И это все только при условии что вы не граждане России.