Скажите, при перелете Эмирейтес на Бали через Дубай багаж сразу на Бали летит, забирать не надо в Дубае?

Верно. Но на стойке регистрации из первого города вылета проверьте на всякий случай.

Если одна авиакомпания, то не надо забирать его, а если разные тогда на регистрации в Москве это только узнать можно.

Привет! Зависит от билета. Если билет 1 сразу до конечного пункта, то да - все так работает, если 2 билета или вы получаете просто отдельно билет Москва-Дубай, то могут и возвращать багаж в Дубай, особенно если разные авиалинии.