Подскажите, пожалуйста, при перелете транзитом через Баку нужен сертификат или пцр-тест?

Смотря куда летите. Если летите транзитом, действуют правила страны конечного пункта.

Пцр не нужен, сертификат не нужен только, если вы не будете выходить из транзитной зоны. Если авиакомпания, которой летите в Баку отличается от авиакомпании, которой летите дальше - сертификат нужен, поскольку в аэропорту вылета сертификат спросят. Мы 5 марта летели из Абу-Даби, мужчину, летевшего в Москву транзитом через Баку не пустили на рейс из-за отсутствия сертификата и поскольку wizzair не может подтвердить, что он летит транзитом, поскольку следующий рейс другой компанией.