Могу я прилететь из милана в Таллинн RYNAIR или WIZZAIR, а потом автобусом в Петербург.

Можете.

Вот, нашла в ответах на kriis, можно влетать в Эстонию, если это транзит домой. Также можно влетать из любой страны Шенгена независимо от причины вьезда.