Подскажите, прилетела в Турцию по одному паспорту, а вылететь из Турции хочу по другому. Билет куплен на другой паспорт.

По какому паспорту влетаете, по тому паспорту и вылетаете. Билеты тут не причем вообще.

На регистрации показываете паспорт, на который куплен билет. На паспортном контроле тот, с которым влетали.