Где лучше выйти из автобуса Таллинн-СПб, чтобы быстрее добраться в аэропорт Пулково? При въезде в город у какого метро? Или на какой остановке и взять такси? Может есть другие варианты?

Метро Московская, оттуда автобус либо такси.

Выходите на Балтийской, если немного вещей - на метро с одной пересадкой до ст. Московская. Там или 39,39э автобусы (каждые 10 минут ходят) или такси. Если неохота под землей ходить- то такси от Балтийской))