в первые дни приезда важно отправить данные в SEF, заселившись в отель. Сколько дней обязательно нужно там пробыть? Видела разную информацию от 1 до 3х дней...

Количество дней не важно, важен факт заселения. Если отель сам регулирует отправку данных за какое то количество дней, то это вопросы к отелю.

Если у вас въезд в шенгенскую зону не в Португалии, то да - подтверждением даты въезда в страну может быть отель. Насколько знаю, одной ночи достаточно. Но важно, чтобы отель отправил данные в СЭФ. Друзья делали одну ночь, при чекине заполнили анкету для СЭФ и сразу же уехали.