А сертификат вакцинации от коронавируса пробивают при прилёте на Бали или просто смотрят? и можно ли просто с ПЦР въехать?

Нет, нельзя. Нужен сертификат о вакцинации.

Более тщательно проверяют на регистрации на рейс, были случаи сканировали по коду и просили открыть госуслуги. По прилету проверяют визуально.