Подскажите пожалуйста, если я из Гонконга прилечу в Токио прямым рейсом? Меня не развернут? Звонила в посольство, они сказали что все ограничения сняты, но как то неуверенно)

Ну если Вы не будете дебоширить, бить пассажиров и метать сотрудников аэропорта в окно, то не развернут. Про какие ограничения, не совсем понял. Если речь о дополнительных тестах на по-видимому для гостей из КНР, то Гонконга они не касаются. Но обычный ПЦР, сданный не ранее чем за 72 часа до вылета пока что никто не отменял.