Подскажите пожалуйста, есть ли какое либо ограничение по сроку в браке для репатриации в Израиль?

Важно что бы у детей было свидетельство о признании отцовства.

Моя сестра ждала год перед подачей документов. После гола брак считается устойчивым и на него смотрят всерьез.

Вам нужно ждать, когда браку будет год. Дети в гражданском браке - это нормально, сами так подавались.