Подскажите, если у нас с мужем и сыном туристический шенген Франции, у сына дополнительно национальная виза Германии, все визы не открыты, планируем лететь в Париж, а оттуда на поезде в Германию, как тогда сын «откроет» национальную визу Германии?

Он с визой Д в черед любую страну ес может въехать (которая пускает, конечно)

Я тоже не могу утверждать с уверенностью, но кмк он просто придет регистрироваться в коммуне и все, штамп о пересечении иметь не обязательно.

Визу не нужно никак открывать в Германии, можно въехать во Францию по ней.