если я найду работодателя в Венгрии. Можно ли в посольстве Венгрии, которое находится в Израиле. Сделать рабочую, венгерскую, визу D?

Должно быть основание, почему Вы подаётесь из Израиля. Увы, скорее всего придётся ехать в страну гражданства.

Если вы резидент Израиля, то да, можете подать там.