Мы получили временный теудат зеут. Но нам сказали, что загранпаспорт мы можем получить не раньше , чем через 3 месяца пребывания в стране.

Пребывание в стране - это нахождение в ней.

Вы должны записаться в МВД (myVisit) на получение загранпаспорта и ждать тут записи.

Идете по записи с отказом от отказа и получаете через три недели.

Если не писать отказ от отказа то заявление на паспорт примут через три месяца со дня репатриации, сидеть эти три месяца в Израиле не обязательно если вам достаточно розового паспорта, а не даркона. Можете записаться и улететь и прилететь снова к дате сдачи биометрии.

Связано с тем, что в течение трёх месяцев новый репатриант имеет право отказаться от полученного израильского гражданства. Если вы таким правом пользоваться не будете, то записывайтесь в МВД на ближайшую доступную дату - можно поймать и на ближайшие дни,(оформляя загранпаспорт подпишете заявление, что не собираетесь отказываться от Израильского гражданства - в обиходе это называют отказ от отказа).