Подскажите, пожалуйста, есть ли какие-то ограничения на отправку почты из России в Эстонию?

Есть. Почты нет . Вам нужно позвонить на Почту РФ, так как со стороны Эстонии почтовое сообщение было прекращено. А вот в ту сторону может и можно что-то отправить. Но нужно узнавать.

Никаких ограничений в работе почты нет. На сайте почты вы можете почитать, что можно и что нельзя отправлять из России.