Подскажите, а на сколько в Казахстане естественно говорить на русском, но здороваться и спасибо на казахском, чисто из уважения к культуре?

Вполне нормально.

Покрутят у виска.))) Шутка! Если вы скажете несколько слов на казахском, вы станете самым уважаемым человеком тут. Вас будут носить на руках. Не бойтесь говорить даже с акцентом, это только приветствуется. Просто большинство местных русских, не особо уважают язык страны в которой живут. Поэтому, когда мы видим, что человек другой национальности пытается говорить на казахском, то очень рады этому.