А можно ли подать на национальную визу Германии, отдавая сам паспорт на обработку?

Стандартная процедура - паспорт отдается. Вряд ли будут делать исключения. Сейчас в довольно быстро все происходит - нам через 3 дня визу дали, не считая дня подачи в визаметрик.

Да! Зависит наверное от типа визы, у меня была на воссоединение, я не отдавала паспорт и в итоге улетела по обычному шенгену, а за нац визой вернулась через пол года. Просто приходишь с утра, отдаешь паспорт, через пару часов забираешь с визой. В москве так.

Если в визаметрик то надо отдавать, если в консульстве, то можно не отдавать.