Когда ты с квитком, а штамп уже закончился ты легально в ЮАР?

Да.

Да. У меня коллега так вылетал. Всё ок. Пограничники в курсе.

Мне вторые 90 дней дали через пять месяцев после истечения первых 90 дней. Всё это время находился тут с квитком легально. В итоге получилось 3+5+3=11 месяцев.