Можно ли визу сделать в Германию в другой стране? Например, в Армении или Казахстане. И там же загранпаспорт.

Можно, но это не быстро, запись в Российское консульство, к примеру, в Алматы в последние полгода доступна только через несколько месяцев. Для получения визы могут просить ВНЖ страны в которой Вы находитесь.