Много ли таких случаев что граждан РФ которые жили в Грузии, после выезда из Грузии(например в Турцию), завернули по возвращению и не пускают больше ?

Немного, в пределах статистической погрешности.

Знаю что такое бывает, в случае если есть просрочки в паспорте на машину например и поставили печать в Турции , в таком случае в Грузию могут не пустить.

С оверстеем, через Сарп, наблюдается такое.