что будет если на израильский шекелевый счет перевести деньги из РФ в долларах если переводящий имеет двойное гражданство? Доллары конвертируются в шекеля или платеж будет отклонен?

Деньги из РФ не примут.

Если не согласуете предварительно с банком, отклонят. Если разрешат, зачислят на шекелевый, если другого нет.

Вы не приводите подробности, но варианты могут быть разными. Hapoalim, например, автоматом открывает долларовый счет.