Можно ли россиянам с визой С прилететь из Испании в Литву, а затем в РБ и потом в РФ? Или это уже невозможно?

Это можно и всегда было можно. Вы же выезжать из Литвы будете, а не въезжать.

Можно и на поезд в Литве сесть и через 12 часов быть в Москве, если есть загран РФ.