Скажите пожалуйста кто летал с детьми без одного родителя (в случае развода), спрашивали ли разрешение на выезд от второго родителя при пересадке в Дубай?

Если нет запрета то нет.

С пересадкой не летали (летаем на прямых) но при полете в Дубай и на Шри-Ланку да вообще и в других странах не спрашивали, главное чтоб супруг не наложил запрет на выезд ребенка, ну и свидетельство о рождении оригинал должен быть с собой.