Подскажите пожалуйста из каких стран и городов самые дешевые билеты в Японию.( То что рядом с Россией условно) Стамбул /Улан Батор и так далее.

Как вариант - Ташкент через сеул.

Я купил билеты на Узбекские Авиалинии из СПб до Сеула с пересадкой в Ташкенте. На днях куплю билеты из Сеула в Токио на JejuAir. Беру на сайте перевозчика на прямую. Это дороже, но в случае чего хотя бы можно будет вернуть деньги. Через агрегаторов дешевле, но на свой страх и риск всегда.

Нам с женой маршрут был Сочи - Ташкент (Uzbekistan Airways) - Сеул (Korean Air) - Токио (All Nippon Airways). Самый дешëвый вариант был на новогодние праздники. Из Питера такой маршрут тоже возможен. Но учтите, что для въезда в Корею нужна K-ETA. Либо берите единый билет из Ташкента у Korean Air или Asiana Airlines.