У меня есть рубли в российском банке. Я хочу положить их во вклад. Есть что-то плохое в том, что я положу их в санкционный банк? Если да, то почему?

Какая разница, где хранить. Храните где считаете нужным.

Если нет планов эти деньги выводить из РФ или переводить в другие валюты, то выбирайте обороты банк, где условия депозита лучше.