если переезжать в Португалию по работе, то эта работа должна быть полный рабочий день? подумала о варианте переезда в Португалию по работе на неполный рабочий день, при этом одновременно работать удалённо

Если коротко, то нет, не должна. Но вообще ваш вопрос очень общий, в засимости от конкретных обстоятельств может быть много разных вариантов со своими особенностями, если это "Residence permit for highly qualified activity", то там тоже есть минимальные требования по зп, например.