по приезду в Португалию в СЕФ можно спокойно прийти в течение 3х дней и уведомить о въезде в страну? Я лечу через Испанию.

Entrada Legal вообще с началом ковидного закона отменена, так говорят все в сеф на колл центре, и поэтому, не записывают. Проще послать емейл им со сканами. Или сохранить посадочные и показать в сеф при подаче.