подскажите про 96-часовой транзит: если из Куала-Лумпура азиатским лоукостером с ручной кладью с онлайн-регистрацией сразу пройти на посадку

Зависит от того, как запрограммировано. Скорее всего это все равно ручная проверка.

Теоретически, да. После распечатки у автомата, только если багаж необходимо сдавать, нужно на стойку. А как по факту, - не могу сказать, к сожалению. Возможно, на паспортном контроле могут спросить что то. И, в клиа 2, походу, вечная часовая очередь на паспортный контроль. Имейте в виду.