Обнаружил, что моя карта онай закончилась, хотя я платил всего два раза ей, видимо, сама карта тоже что-то стоит в Казахстане? Брал за 500 в ларьке.

Да, тут писали, что при покупке там какая-то мизерная сумма на баланс попадает.

Карта ONAY стоит 500 тенге. Из них 420 тенге - это залоговая стоимость самой карты, а на балансе карты будет всего 80 тенге. Т. е. хватит всего на одну поездку в общественном транспорте. А дальше можно пополнять баланс карты Onay.