можно ли сначала до Еревана полететь потом оттуда билет взять до Кишинева?

Можно.

Мы брали сразу до Кишинева , транзит Ереван, 8,5 часов вместе с пересадкой.

Я брал билет Ереван-Кишинёв после того, как прошёл паспортный контроль в России. В Ереване вообще не спросили ни транзитом ли я, ни срок пребывания - просто "Добро пожаловать! " .