Подскажите, могу ли я, как студент, выводить заработок с фриланса на немецкую карту (вроде как студентам фриланс не разрешен) или у налоговой будут вопросы?

По хорошему - не работать фрилансером. Налоговой по большому счету все равно, главное, чтобы налоги платили. У абх могут возникнуть вопросы, если покажете эти доходы.