Что будет , проживая в Испании по туристской визе на срок 3 месяца, человек не выезжает из страны?

А в чём вопрос-то, собственно. Если виза на 3 месяца - может проживать 3 месяца. Если многократная, то может выезжать. Если однократная - не может:) Но однократная с правом проживания 90 дней - это нонсенс.

В дальнейшем будут придираться, когда будете получать шенген Могут даже отклонить выдачу из-за превышения срока пребывания.