Подскажите, пожалуйста, при перелете Fly One Armenia из Тбилиси в Москву при пересадке в Ереване надо выходить и пересаживаться на другой самолет или тот же самый летит дальше ?

Обычно пишется при покупке в билете, транзитом или с выходом в город, если транзитом, то просто переход из самолёта через специальный коридор (сверху написано транзит)(багаж забирать не надо), если с выходом в город, то выход из самолёта , получение багажа и заново регистрация на рейс.