Выехал из Шенгена в Хорватию. В Словении вообще не было контроля. В Хорватии поставили печать о въезде. Я покинул Шенген на данный момент? 90 дней

Да.

Та же ситуция. Спецом вернулся на границу на следующий день, хорваты сказали не волноваться, для Шенгена штамп о въезде в Хорватию эквивалентен штампу о выезде из Шенгена. В Словении никто не поставит штамп, сказали. Но добавили странную вещь. Что как только Хорватия вступит в Шенген (ожидается 1 января), то ВСЕ ВРЕМЯ, которое вы провели в Хорватии будет считаться временем в Шенгене (а не только дни с 1 января) если вы будете покидать Хорватию после 1го января. Звучит очень нелогично, может, они и дезинформировали.

Да, покинули.