визу в Японию откуда-то из заграницы реально оформить, или россиянам только из России можно подавать?

Насколько я знаю, зарубежом только если есть резиденство страны пребывания. НО посольство Японии в РФ настолько адекватное, что принимает заявления по доверенности.(Если не отменили это)