Кто нибудь подавался семьей на D3 ( 90. 2) из Израиля ( Тель-Авив)? Нужно ли супруге ( гражданке только РФ, в Израиле ВНЖ)

Если человек не имеет гражданства или ВНЖ в стране, откуда он собирается запрашивать визу (D или шенген), то документы на визу у него не примут, нет оснований. Смысл подачи на D в том, что бы въехать в Португалию и быстро (относительно) получить ВНЖ. Если въехать в страну по шенгену и подаваться тут на ВНЖ, то надо быть готовым к тому, что в течении ближайших 2х лет не сможете покинуть Португалию.